أنشأت اللجنة الوطنية لمكافحة الإرهاب بوزارة الداخلية في 26 مارس 2007 بموجب قرار مجلس الوزراء رقم (7) لسنة 2007، الملغى والمعوض بقرار مجلس الوزراء رقم (29) لسنة 2020 الصادر بتاريخ 16 سبتمبر 2020 بتشكيل اللجنة الوطنية لمكافحة الإرهاب وتحديد نظام عملها ومكافآت أعضائها.



